Tem como objetivo difundir, capacitar e formar profissionais de saúde na visão funcional integrativa por meio de cursos, pós-graduações, especializações, congressos e extensões. Promovendo essa abordagem que enxerga o indivíduo de uma forma completa, indivisível, onde o foco é na saúde e na prevenção, e não apenas em tratar a doença e os seus sintomas.
A visão Funcional Integrativa enxerga o paciente como um todo indivisível, unindo diversas áreas do conhecimento para que todas, interligadas, olhem para o ser humano integralmente, com o objetivo de prevenir doenças, promover saúde e tratar as causas das doenças em definitivo, e não apenas remediar os seus sintomas.
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A Academia Brasileira de Medicina Funcional Integrativa tem como missão difundir, propagar e ensinar a visão de saúde que olha o indivíduo de uma forma completa, funcional, integral e, assim, tornar a saúde novamente uma profissão mais do que humanizada, integrada e que a despeito da segmentação necessária através das diferentes especialidades e sub-especialidades, enxergando indivíduo como um todo indivisível.